MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Polymorphum gilvum SL003B-26A1 plasmid pSL003B

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015258	GAC	2	6	30	35	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015258	GATC	2	8	7776	7783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015258	CCT	2	6	9418	9423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015258	GGC	2	6	9449	9454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015258	CGC	2	6	9466	9471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015258	GCCG	2	8	9513	9520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015258	GCC	2	6	9548	9553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015258	AAG	2	6	9595	9600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015258	CGGA	2	8	10624	10631	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015258	GGC	2	6	10634	10639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015258	GAAGA	2	10	10665	10674	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015258	CAA	2	6	11762	11767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015258	CCGC	2	8	11780	11787	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_015258	CTG	2	6	17077	17082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015258	ACG	2	6	17560	17565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015258	GAAG	2	8	17573	17580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015258	G	6	6	17580	17585	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015258	TGC	2	6	17653	17658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015258	AGG	2	6	17692	17697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015258	AAAG	2	8	17698	17705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015258	CGC	2	6	17739	17744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015258	CCGC	2	8	17846	17853	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_015258	CTTTC	2	10	19803	19812	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015258	ATG	2	6	19815	19820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015258	CCG	3	9	19823	19831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015258	CGG	3	9	19843	19851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015258	CGC	2	6	21296	21301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015258	GCG	2	6	21376	21381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015258	CGG	2	6	21395	21400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015258	CCGC	2	8	21407	21414	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_015258	GGC	2	6	21451	21456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015258	CG	3	6	21505	21510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015258	CAG	2	6	21512	21517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015258	GCC	2	6	21518	21523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015258	CGC	2	6	21526	21531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015258	GTC	2	6	21585	21590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015258	CGT	2	6	21596	21601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015258	GAG	2	6	21604	21609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015258	GCC	2	6	22218	22223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015258	CCG	3	9	22233	22241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015258	AGG	2	6	22280	22285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015258	CGC	2	6	22466	22471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015258	GGC	2	6	22474	22479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015258	CTC	2	6	22603	22608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015258	G	6	6	22638	22643	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015258	CCG	2	6	23301	23306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015258	GGC	2	6	23309	23314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015258	TGG	2	6	23348	23353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015258	GAAA	2	8	23362	23369	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015258	GCC	2	6	23486	23491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015258	AGA	2	6	23556	23561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015258	ATT	2	6	24601	24606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015258	GCCA	2	8	25286	25293	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015258	AGG	2	6	25320	25325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015258	CGA	2	6	25354	25359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015258	GA	3	6	25740	25745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015258	GAT	2	6	25796	25801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015258	GAC	2	6	25870	25875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015258	TTC	2	6	25915	25920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015258	GCT	2	6	25959	25964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015258	GCC	2	6	25969	25974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015258	GAG	2	6	26410	26415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015258	GCC	2	6	26602	26607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015258	CGC	2	6	26631	26636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015258	CGT	2	6	26690	26695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015258	GAC	2	6	26715	26720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015258	GAA	2	6	26769	26774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015258	CCG	2	6	26793	26798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015258	GCG	2	6	26806	26811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015258	GAGCTG	2	12	26812	26823	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015258	GCC	2	6	26839	26844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015258	CCT	2	6	26881	26886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015258	AGG	2	6	26891	26896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015258	TGC	2	6	26905	26910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015258	CAG	2	6	26917	26922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015258	GAT	2	6	27213	27218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015258	TTC	2	6	27224	27229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015258	ATC	2	6	27240	27245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015258	TGA	2	6	27637	27642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015258	CGC	2	6	27647	27652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015258	CGG	2	6	27667	27672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015258	GTC	2	6	27680	27685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015258	GCG	2	6	27692	27697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015258	CGC	2	6	27716	27721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015258	GCG	2	6	27769	27774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015258	CCT	2	6	30077	30082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015258	GAC	2	6	30110	30115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015258	CGC	2	6	30121	30126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015258	CGC	2	6	30144	30149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_015258	CCG	2	6	30170	30175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015258	GTC	2	6	30187	30192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015258	GC	3	6	30215	30220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015258	GCGAG	2	10	31049	31058	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015258	TGATT	2	10	31130	31139	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015258	CCAG	2	8	31271	31278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015258	TGA	2	6	31292	31297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015258	AGC	2	6	31324	31329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015258	TCT	2	6	31358	31363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015258	CAG	2	6	31374	31379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015258	GCA	2	6	31391	31396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015258	GCG	3	9	31443	31451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015258	CG	4	8	31493	31500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015258	TGGG	2	8	31620	31627	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015258	ATC	2	6	31648	31653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015258	ACG	2	6	31658	31663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015258	AGA	2	6	31668	31673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015258	GC	3	6	31713	31718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015258	TCG	2	6	31724	31729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015258	CCGCG	2	10	31743	31752	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_015258	TGAT	2	8	31769	31776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015258	GGT	2	6	31884	31889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015258	GAT	2	6	31906	31911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015258	CCG	2	6	31940	31945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015258	GTGC	2	8	31962	31969	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015258	AGC	2	6	31989	31994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015258	GGC	2	6	31995	32000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015258	GCC	2	6	32013	32018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015258	CGC	2	6	32094	32099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015258	CG	3	6	32205	32210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015258	TCC	2	6	32360	32365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_015258	CCT	2	6	32379	32384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015258	GCC	2	6	32399	32404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015258	CGG	2	6	32454	32459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015258	GC	3	6	33349	33354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015258	GCC	2	6	33815	33820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015258	ACTG	2	8	33844	33851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015258	GCCA	2	8	34024	34031	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015258	GCAT	2	8	34147	34154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015258	GAG	2	6	34238	34243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015258	GCC	2	6	34249	34254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015258	GTA	2	6	34286	34291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015258	CGA	2	6	34302	34307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015258	GCG	2	6	34362	34367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015258	CAG	2	6	34371	34376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015258	CGA	2	6	34406	34411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015258	CGG	2	6	34456	34461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015258	CGG	2	6	34501	34506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015258	CG	3	6	34507	34512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015258	GCA	2	6	35710	35715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015258	CGG	2	6	35729	35734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015258	CGA	2	6	35896	35901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015258	GCA	2	6	35931	35936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015258	AATC	2	8	35970	35977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015258	CGG	2	6	36935	36940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015258	AGGG	2	8	37032	37039	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015258	GCCGC	2	10	37825	37834	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
147	NC_015258	CGG	2	6	37849	37854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015258	GAG	2	6	39381	39386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015258	GCC	2	6	40515	40520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_015258	GAG	2	6	40577	40582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015258	AG	3	6	43279	43284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015258	GGA	2	6	44362	44367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015258	GAG	2	6	44385	44390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015258	AAT	2	6	44410	44415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015258	GAT	2	6	44450	44455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015258	GCC	2	6	44489	44494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_015258	T	6	6	44504	44509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015258	G	6	6	46726	46731	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015258	AAC	2	6	46737	46742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_015258	AGC	2	6	46752	46757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_015258	GAC	2	6	51506	51511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_015258	GAC	2	6	51551	51556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_015258	ATC	2	6	57152	57157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_015258	TGC	2	6	57161	57166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_015258	CGG	2	6	57209	57214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_015258	TGAT	2	8	57329	57336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015258	CCA	2	6	58744	58749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_015258	CAA	2	6	58785	58790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_015258	GCC	3	9	58815	58823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_015258	GCT	2	6	58827	58832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_015258	TTG	2	6	58844	58849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015258	GCC	2	6	58864	58869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_015258	CCG	2	6	58872	58877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_015258	TCT	2	6	60076	60081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_015258	CGG	2	6	60099	60104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_015258	TCA	2	6	62440	62445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_015258	TTG	2	6	62502	62507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_015258	TCG	2	6	62557	62562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_015258	GGT	2	6	62574	62579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
181	NC_015258	GCC	2	6	62608	62613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_015258	CG	4	8	62625	62632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
183	NC_015258	TGGC	2	8	62687	62694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
184	NC_015258	TTA	2	6	62698	62703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015258	CCA	2	6	63851	63856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_015258	TTG	2	6	63906	63911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015258	G	6	6	65949	65954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015258	GCG	2	6	67287	67292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.